Uma das principais causas da microcefalia está ligada diretamente ao vírus zika, transmitido pelo Aedes agegypti, também transmissor da dengue e da chikungunya. Na Bahia, no primeiro semestre deste ano foram registrados 50.872 casos de zika, 39.584 de chikunguya e 58.664 casos prováveis de dengue.
Ainda cs 1.6 2016 blaze em relação ao zika vírus, responsável pelo surto de microcefalia em todo o país, a Bahia teve 347 municípios com casos da doença, o equivalente a 83,25% do estado. Mais da metade das pessoas infectadas com zika na Bahia são do sexo feminino.