Um inquérito policial foi instaurado pelo delegado Dr. Manoel Andreetta para investigar a autoria e motivação do crime.
A roma 888 PRF produziu um relatório, com informações decorrentes das ocorrências policiais e do levantamento de dados no período de 2007, 2008 e 2009, que foi apresentado ao Ministério Público da Bahia. A união entre a PRF, MP/BA e o IBAMA para investigar as ações criminosas foi considerada fundamental para descobrir uma verdadeira organização criminosa que agia no desmatamento ilegal de áreas de florestas nativa com a utilização da mesma autorização de exploração por diferentes usuários e propriedades; na produção ilegal de carvão em fornos clandestinos em grande escala; atuação de agenciadores na intermediação entre produtor, comerciante e transporte, utilizando falsificações de DOF e Notas Fiscais, além da reutilização destes documentos; criação de empresas fantasmas para o esquema; a descoberta da produção e exportação de aço brasileiro com selo de sustentabilidade ecológica por quatro grandes usinas siderúrgicas mineiras que se utilizavam deste esquema. Estima-se que a organização chegou a movimentar cerca de 70 milhões com o negócio ilegal.